1 Sissejuhatus

See õpik on kirjutatud inimestele, kes kasutavad, mitte ei uuri, statistikat. Õpiku kasutaja peaks olema võimeline töötama R keskkonnas. Meie lähenemised statistika õpetamisele on arvutuslikud, mis tähendab, et me eelistame meetodi matemaatilise aluse asemel õpetada selle kasutamist ja tulemuste tõlgendamist. See õpik on bayesiaanlik ja ei õpeta sageduslikku statistikat. Me usume, et nii on lihtsam ja tulusam statistikat õppida ja et Bayesi statistikat kasutades saab rahuldada 99% teie tegelikest statistilistest vajadustest paremini, kui see on võimalik klassikaliste sageduslike meetoditega. Me usume ka, et kuigi praegused kiired arengud bayesi statistikas on tänaseks juba viinud selle suurel määral tavakasutajale kättesaadavasse vormi, toovad lähiaastad selles vallas veel suuri muutusi. Nende muutustega koos peab arenema ka bayesi õpetamine.

Me kasutame järgmisi R-i pakette, mis on kõik loodud bayesi mudelite rakendamise lihtsustamiseks: “rethinking” (McElreath 2016), “brms” (Bürkner 2017), “rstanarm” (Stan Development Team 2016), “BayesianFirstAid” (Bååth 2013) ja “bayesplot” (Gabry and Mahr 2017). Lisaks veel “bayesboot” bootstrapimiseks (Bååth 2016). Bayesi arvutusteks kasutavad need paketid Stan ja JAGS mcmc sämplereid (viimast küll ainult `BayesianFirstAid pakett). Selle õpiku valmimisel on kasutatud McElreathi (McElreath 2015), Kruschke (Kruschke 2015) ja Gelmani (Gelman et al. 2014) õpikuid.

Bibliograafia

Bååth, Rasmus. 2013. “Bayesian First Aid.” Tba. tba.

Bååth, Rasmus. 2016. Bayesboot: An Implementation of Rubin’s (1981) Bayesian Bootstrap. https://CRAN.R-project.org/package=bayesboot.

Bürkner, Paul-Christian. 2017. “brms: An R Package for Bayesian Multilevel Models Using Stan.” Journal of Statistical Software 80 (1): 1–28. doi:10.18637/jss.v080.i01.

Gabry, Jonah, and Tristan Mahr. 2017. Bayesplot: Plotting for Bayesian Models. http://mc-stan.org/bayesplot.

Gelman, Andrew, John B Carlin, Hal S Stern, David B Dunson, Aki Vehtari, and Donald B Rubin. 2014. Bayesian Data Analysis. Vol. 2. CRC press Boca Raton, FL.

Kruschke, John. 2015. Doing Bayesian Data Analysis: A Tutorial with R, Jags, and Stan. 2nd ed. Academic Press / Elsevier.

McElreath, Richard. 2015. Statistical Rethinking: A Bayesian Course with Examples in R and Stan. CRC Press.

McElreath, Richard. 2016. Rethinking: Statistical Rethinking Book Package.

Stan Development Team. 2016. Rstanarm: Bayesian Applied Regression Modeling via Stan. http://mc-stan.org/.